В 1956 году в р.п. Вахтан было создано образовательное учреждение Вахтанский Дом пионеров.

В 1992 году при слиянии Вахтанского Дома пионеров и клуба по месту жительства  Вахтанский Дом пионеров был переименован  в  Вахтанский Детско-юношеский центр, и    зарегистрирован     на     основании     распоряжения  администрации Шахунского  района Нижегородской  области  № 485-р от02 июля 1992 года.

 В 1998 году  Вахтанский Детско-юношеский центр был переименован  в Муниципальное учреждение дополнительного образования Вахтанский Детско-юношеский центр, и    зарегистрирован     на     основании     распоряжения  администрации Шахунского  района Нижегородской  области  № 145-р от 27 марта 1998 года.

В 2004году Муниципальное учреждение дополнительного образования Вахтанский Детско-юношеский центр был переименован  в Муниципальное образовательное учреждение дополнительного образования детей Вахтанский Детско-юношеский центр, и    зарегистрирован     на     основании     распоряжения  администрации Шахунского  района Нижегородской  области  № 63-р от 11 февраля 2004 года.

В 2012 году на основании распоряжения администрации Шахунского района №1063-р от 28.12.2012 года  «О переименовании муниципальных образовательных учреждений» учреждение было переименовано в Муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей Вахтанский Детско-юношеский центр.

В 2012г. Администрация Шахунского района Нижегородской области реорганизована путем слиянияс администрациями городских поселений Шахунского района и администрациями сельских поселений Шахунского района во вновь возникшее муниципальное казенное учреждение администрацию городского округа город Шахунья Нижегородской области распоряжение администрации Шахунского района Нижегородской области № 343-л от 28.12.2012года.

В 2015 году в соответствии с 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации», на основании распоряжения администрации городского округа город Шахунья №140-р от 14.05.2015 года «О переименовании  образовательных организаций городского округа город Шахунья Нижегородской области» Муниципальное бюджетное образовательное учреждение дополнительного образования детей Вахтанский Детско-юношеский центр переименован в Муниципальное бюджетное учреждение дополнительного образования «Вахтанский детско-юношеский центр».